催乳素处理的乳腺癌T-47D细胞lncRNA和mRNA表达谱差异分析

• 作者: 姚俊 曹新 朱林静 魏钦俊 鲁雅洁
• 来源期刊: 生物技术通讯
• 学科: 生物学
• 关键词: 长链非编码RNA 表达谱 乳腺癌 催乳素 T-47D细胞
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 577-583
• 页数: 7页
• 分类号: Q78|Q811.4
• 字数: 3819字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-0002.2017.05.001

摘要

目的:观察催乳素处理引起乳腺癌T-47D细胞中长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA表达谱的变化.方法:利用转录组测序技术检测催乳素处理前后乳腺癌T-47D细胞中lncRNA和mRNA的表达谱;通过数据库KEGG、GO富集对有差异表达且具有统计学意义的mRNA进行通路分析,得到mRNA参与的生物学途径;运用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术对部分差异表达的lncRNA(lnc-AK4-2、XLOC_075541、XLOC_093371、XLOC_081110、XLOC_047068、XLOC_006637、XLOC_064063、XLOC_086865、XLOC_099517、XLOC_106798、lnc-ZNF639-1)进行验证,并利用生物信息学方法预测其靶基因,通过数据库KEGG、GO富集对差异lncRNA的靶基因进行通路分析.结果:分析得到3564个差异lncRNA和477个差异mRNA(差异倍数＞2,P＜0.05),差异表达的mRNA主要富集在134条不同的信号通路,其中包括催乳素/催乳素受体信号通路相关的MAPK信号通路、p53信号通路和JAK-STAT信号通路;选取的11条lncRNA的变化趋势(XLOC_093371、XLOC_006637、XLOC_064063、XLOC_086865、lnc-ZNF639-1表达上调,lnc-AK4-2、XLOC_075541、XLOC_081110、XLOC_047068、XLOC_099517、XLOC_106798表达下调)经qRT-PCR技术得到验证;lncRNA靶基因富集的信号通路同样包括MAPK信号通路.结论:催乳素处理前后T-47D细胞中lncRNA的表达存在明显差异,为进一步研究与乳腺癌发病机制相关的关键lncRNA分子提供了基础,并为寻找乳腺癌潜在的诊疗方法提供理论支持.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲁雅洁	南京医科大学基础医学院生物技术系	24	70	4.0	7.0
2	魏钦俊	南京医科大学基础医学院生物技术系	44	194	8.0	11.0
3	姚俊	南京医科大学基础医学院生物技术系	42	154	7.0	11.0
4	曹新	南京医科大学基础医学院生物技术系	61	324	10.0	15.0
5	朱林静	南京医科大学基础医学院生物技术系	1	0	0.0	0.0