兔眼蓝莓组培红色突变株CHS基因的克隆与分析

• 作者: 刘小珍 刘艳艳 张汉尧 朱芳明
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 生物信息学 兔眼蓝莓 组织培养 CHS 花青素
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 864-870
• 页数: 7页
• 分类号: S663|Q291
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.05.013

摘要

蓝莓Vaccinium spp.果实含有丰富的花青素,但目前对蓝莓花青素合成相关基因的研究还较少.为分析蓝莓花青素合成相关基因,也为今后高花青素含量品种的育种工作提供一定的生物信息学基础,以红色突变兔眼蓝莓Vaccinium ashei为试验材料,采用同源克隆方法,克隆到查尔酮合成酶基因(CHS)的cDNA全长.生物信息学分析表明:该基因cDNA全长1398 bp,有1个1170 bp的完整开放阅读框(ORF),编码389个氨基酸.与杜鹃Rhodo-dendron simsii,山茶Camellia japonica,红花油茶Camellia chekiangoleosa,中华猕猴桃Actinidia chinensis,高丛蓝莓Vaccinium corymbosum,苹果Malus domestica的CHS基因同源性分别为90%,83%,83%,83%,83%与82%.兔眼蓝莓CHS基因编码的蛋白不存在信号肽,无跨膜结构域,定位于细胞质中,肽链表现为疏水性,α-螺旋和随机卷曲是其蛋白质二级结构中量最大的结构元件,β-转角和β-折叠散布于整个蛋白质中,对编码的蛋白的结构域预测显示该蛋白含有类似查尔酮合成酶超家族(CHS-like超家族)结构域.由此推测:兔眼蓝莓CHS基因是高度保守的,表达的蛋白为疏水性蛋白,是一种结构和性质都相对稳定的蛋白.图4表1参20

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘小珍	西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室	14	34	4.0	5.0
2	张汉尧	西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室	26	100	6.0	8.0
3	刘艳艳	西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室	1	1	1.0	1.0
4	朱芳明	西南林业大学云南省高校林木遗传改良与繁育重点实验室	8	28	4.0	5.0