应用生物信息学方法识别卵巢癌重要基因

• 作者: 李辉
• 来源期刊: 肿瘤
• 学科: 医学
• 关键词: 卵巢肿瘤 RNA-Seq 生物标志物
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 511-517
• 页数: 7页
• 分类号: R737.31
• 语种: 中文
• DOI: 10.3781/j.issn.1000-7431.2017.33.120

摘要

目的:上皮细胞卵巢癌是目前最常见的妇科恶性肿瘤之一,其发病率每年都在升高.本次研究识别的重要基因能够预测上皮细胞卵巢癌患者的预后,阐释上皮细胞卵巢癌的发病机制.方法:本研究利用4对上皮细胞卵巢癌及其癌旁正常组织的转录组测序(RNA-Seq)数据进行差异基因的筛选,并应用Gene Ontology (GO)进行富集分析,在TCGA(The Cancer Genome Atlas)在线数据库中进行预后评估.结果:识别865个差异表达基因,通过功能注释识别13个有意义的GO类型,包括转录调控(regulation of transcription)、细胞黏附(cell adhesion)和生物黏附(biological adhesion).结合卵巢癌TCGA在线数据库,发现2个重要基因(FBXO5和CTNNB1)在高表达时,不利于上皮细胞卵巢癌患者的生存;并且在独立的另外20对上皮细胞卵巢癌及其癌旁正常组织的样本中,采用PCR证实了这2个基因的差异表达情况.结论:本研究识别出的重要基因有助于更好地了解上皮细胞卵巢癌的发生和发展机制,可能成为预后判断的生物标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李辉		17	31	3.0	5.0