湖羊NR5A1基因SNPs筛选及其与产羔数的关联分析

• 作者: 孟春花 张俊 曹少先 李隐侠 王慧利 钟声 钱勇
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 湖羊 NR5A1基因 SNPs PCR-RFLP AS-PCR 关联分析
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 124-132
• 页数: 9页
• 分类号: S826
• 字数: 4967字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2017.01.020

摘要

为探讨NR5A1基因能否作为湖羊产羔性状的候选基因,同时寻找与湖羊繁殖性能相关的分子标记,以高繁殖力湖羊为研究对象,采用DNA池结合测序方法筛选NR5A1基因在湖羊中的SNPs位点,并利用PCR-RFLP和AS-PCR方法进行多态位点分型,利用SPSS软件分析不同基因型与湖羊产羔数的相关性.结果表明,在湖羊NR5A1基因中检测到6个SNPs位点,分析发现g.6052A/G位点为TaqI酶切位点,其余5个位点处没有酶切位点存在.在湖羊群体中,g.3362 G/C(GG、GC、CC)、g.4342G/A(GG、GA、AA)、g.4666C/T(CC、CT、TT)、g.6052A/G(GG、AG、AA)和g.6991T/G(TT、TG、GG)位点均检测到3种基因型,而昏5699C/G位点在湖羊群体中仅发现2种基因型GG和GC.6个位点的多态信息含量(PIC)从0.306到0.375不等,均属于中度多态(0.25＜PIC＜0.50),杂合度(He)从0.377到0.500,在这6个SNPs位点中,仅g.6052A/G位点处于Hardy-Weinberg平衡状态.连锁分析发现,g.3362 G/C和g.6052A/G 2位点在湖羊群体中紧密连锁,二者共构建了8种单倍型组合,AAGG为主要的单倍型,占总数的35.90％,AGCG和AACG次之,分别占总数的20.30％和18.75％.关联分析发现昏6052A/G位点GG型湖羊的平均产羔数显著高于AA型(P＜0.05)和AG型(P＜0.05),其余位点的各基因型在湖羊的头胎产羔数、二胎产羔数、三胎产羔数和平均产羔数间差异均不显著.AAGG单倍型和AACG单倍型的二胎产羔数比AGCG单倍型的二胎产羔数分别多0.40 (P＜0.05)和0.53 (P＜0.01),差异显著.说明,NR5A1基因对湖羊产羔数有一定的影响,g.6052A/G位点、g.3362 G/C和g.6052A/G连锁可作为湖羊繁殖性能的有效遗传标记,用于湖羊的分子选育.