中华绒螯蟹免疫蛋白互作网络提取及分析

• 作者: 孙金生 宁黔冀 彭玮 王倩 王彬 郝彤
• 来源期刊: 天津师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 中华绒螯蟹 蛋白互作网络 邻接节点注释 免疫蛋白
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 40-45
• 页数: 6页
• 分类号: Q816
• 字数: 4229字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-1114.2017.04.009

摘要

为了研究中华绒螯蟹的免疫蛋白作用机制,在已构建的中华绒螯蟹蛋白互作网络基础上,采用邻接节点注释方法对其全局网络进行细胞组分注释,为网络的903个未定位蛋白中的830个添加了GO注释,占未定位蛋白的91.9％.从中华绒螯蟹蛋白互作网络中提取了包含142个蛋白和158条蛋白互作关系的免疫互作网络,并且结合GO细胞组分注释信息,得到了其中62个免疫蛋白的细胞组分定位.通过对细胞定位的分析发现,中华绒螯蟹的免疫蛋白多位于膜结构、细胞核和细胞骨架中.