基于锁核苷酸(LNA)增敏的植烟土壤青枯雷尔氏菌定量PCR检测

• 作者: 冯小虎 周汉平 奚家勤 宋纪真 尹启生 张友武 张志高 李琰琰 牟文君 胡利伟 薛超群 郭建华
• 来源期刊: 烟草科技
• 学科: 农学
• 关键词: 植烟土壤 青枯雷尔氏菌 锁核苷酸(LNA) 定量PCR
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 烟草农学
• 页码范围: 14-21
• 页数: 8页
• 分类号: S432.41
• 字数: 6114字
• 语种: 中文

摘要

为了定量检测植烟土壤中青枯雷尔氏菌的数量,有效防控烟草青枯病,构建了一种锁核苷酸(LNA)荧光定量PCR检测方法.以青枯雷尔氏菌细胞色素c基因(Cyt c)(NCBI Genebank序列号:WP_011002214.1)为靶标,采用LNA技术合成覆盖目标片段的引物序列,结合荧光定量PCR技术,进行了植烟土壤中烟草青枯雷尔氏菌数量的快速检测.结果表明,所构建的Cyt c基因标准曲线的R2>0.99,相关性较好.与普通DNA引物相比,采用Cyt c基因LNA引物进行的PCR适用退火温度更高,扩增效率也更高.通过对水稻土发病烟田18个土壤样品的检测,表明青枯雷尔氏菌数量在2.52×104~1.88×107个/g土壤之间.因此,构建的一种基于Cyt c基因的LNA增敏定量PCR检测体系,适用于水稻土等植烟土壤中青枯雷尔氏菌的定量检测,对烟田土壤的提前检测有助于烟草青枯病发生的预警.