鲤脾脏高丰度micoRNA let-7a序列特征、组织表达及功能预测分析

• 作者: 刘变枝 孙向丽 李国喜 王杰 赵银丽 郭国军
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲤 let-7a 序列特征 组织表达谱 生物学功能
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 页码范围: 1177-1185
• 页数: 9页
• 分类号: Q344+.1
• 字数: 6376字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2017.146

摘要

先前研究表明let-7a为鲤(Cyprinus carpio)脾脏高丰度miRNA,但其功能尚不清楚.为全面了解鲤let-7a的潜在生物学功能,研究分析了其成熟序列特征、组织表达谱和靶基因富集情况.结果显示,let-7a在鲤脾脏中存在序列长度变异和碱基替换,长度为18-25 nt,碱基替换类型有9种,种子区序列碱基替换率达2.1％.表达谱分析表明,let-7a为广泛性高丰度miRNA,具明显的时序表达特征,其在鳃、肠、脾脏和肾脏等免疫相关器官中的表达水平明显高于其他器官.GO富集分析显示,let-7a与转录调控、细胞刺激应答、离子转运、跨膜运输、蛋白质氨基酸磷酸化和细胞迁移等生物学过程密切相关,尤其是靶基因GO term在刺激应答相关的许多生物学过程显著富集.总之,鲤let-7a可广泛参与多种生物学过程调控,尤其是机体各种刺激应答.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵银丽		47	146	6.0	10.0
2	李国喜		64	480	11.0	20.0
3	郭国军		14	15	3.0	3.0
4	刘变枝		2	0	0.0	0.0
5	王杰		8	13	2.0	3.0
6	孙向丽		7	1	1.0	1.0