不同地理居群破布叶的psbA-trnH和ITS2序列及其聚类分析

• 作者: 吴海燕 张宏意 李坤平 林爽
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 破布叶 psbA-trnH ITS2 DNA条形码 分子鉴定
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1403-1408
• 页数: 6页
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2017.07.024

摘要

目的 探讨破布叶Microcos paniculata不同地理居群间的DNA序列变异与地理分布的关系,为其种质资源评价和基原植物的分子鉴定提供参考.方法 对破布叶14个居群14份个体样品以改良的3×CTAB法提取基因组DNA,选择特异的引物扩增ITS2和psbA-trnH序列;PCR扩增产物直接双向测序分析.DNAMAN 8.0软件处理测序数据,MEGA6.0软件计算K2P遗传距离,运用NJ法构建系统聚类树.结果 破布叶14个居群的ITS2序列均为462 bp,共检测到14个变异位点,居群间遗传距离0.000 0～0.019 8.除云南景洪居群样本的psbA-trnH序列存在8bp缺失外,其他13个居群样本的psbA-tmH序列均长387 bp,无变异,居群间遗传距离为0.000 0.结论 不同地理居群破布叶的psbA-trnH较ITS2更为保守,二者PCR扩增引物特异性好,扩增效率和测序成功率高,对其药材及基原植物的分子鉴定可采用psbA-trnH为主,ITS2序列为辅的DNA条形码技术.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴海燕	广东药科大学药学院	5	17	3.0	4.0
2	林爽	广东药科大学中药学院	7	19	3.0	4.0
3	李坤平	广东药科大学药学院	18	27	3.0	5.0
4	张宏意	广东药科大学中药学院	10	20	3.0	4.0