水痘-带状疱疹病毒Oka株和84-7株基因特征的分析

• 作者: 何云松 刘亚宇 刘晔 廖海棠 邹蔚然 麻广
• 来源期刊: 微生物学免疫学进展
• 学科: 医学
• 关键词: 水痘-带状疱疹病毒 Oka株 84-7株 酶切位点 基因特征 同源性
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 27-31
• 页数: 5页
• 分类号: R373.1+2
• 字数: 4329字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13309/j.cnki.pmi.2017.01.006

摘要

目的 对水痘-带状疱疹病毒(varicella-zoster virus, VZV)Oka株和84-7株的部分基因特征进行分析,为建立Oka株和84-7株的鉴别方法提供依据. 方法 利用PCR技术扩增相关基因,并运用生物信息学软件对水痘-带状疱疹病毒OKa株和84-7株的PstI酶切位点、抗原蛋白基因序列(ORF14,ORF68)、高突变区域(ORF62)及84-7株复制起点进行序列比较和分析.结果 Oka株酶切位点特征为PstI-SmaI+BssHII+ NaeI+,84-7株的酶切位点特征为PstI+SmaI-BssHII- NaeI-;Oka株和84-7株ORF14编码的蛋白质同源性为99.8%,3个碱基的差异导致了3个氨基酸的变化,且这两株病毒株的R2可变区的串联重复单位拷贝数均为7;Oka株和84-7株ORF68编码的蛋白质同源性为100%,且存在2个低复杂性区域(LCR);ORF62编码区蛋白质的同源性为99.2%,具有14个低复杂性区域;84-7株复制起点区域包含一个13TA+19GA结构. 结论 Oka株和84-7株的同源性很高,但在酶切位点方面存在差异,可用于Oka株和84-7株的鉴别,为今后确立水痘-带状疱疹病毒毒株的鉴别方法提供依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邹蔚然	成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室	1	1	1.0	1.0
2	刘亚宇	成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室	1	1	1.0	1.0
3	廖海棠	成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室	1	1	1.0	1.0
4	麻广	成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室	1	1	1.0	1.0
5	何云松	成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室	1	1	1.0	1.0
6	刘晔	成都生物制品研究所有限责任公司病毒性疫苗二室	1	1	1.0	1.0