曲腿龟甲轮虫和热带龟甲轮虫的mtDNA COI基因和rDNA ITS序列差异以及几种龟甲轮虫的系统发生关系

• 作者: 余红宇 席贻龙 许丹丹
• 来源期刊: 安徽师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 曲腿龟甲轮虫 热带龟甲轮虫 mtDNA COI基因 rDNA ITS序列 系统发生关系
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 155-159
• 页数: 5页
• 分类号: Q178.1
• 字数: 2689字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14182/J.cnki.1001-2443.2017.02.010

摘要

从芜湖市镜湖和汀棠湖中分别采得曲腿龟甲轮虫(Keratella valga)和热带龟甲轮虫(K.tropica)个体,实验室内对其进行克隆培养.运用常规的分子生物学技术,对各30个曲腿龟甲轮虫克隆和热带龟甲轮虫克隆分别进行了mtDNA COI基因和rDNA ITS的扩增、测序和序列分析.以萼花臂尾轮虫轮虫(Brachionus calyci florus)为外群,结合Genbank上已登录的几条其它龟甲轮虫COⅠ基因和ITS序列,以及测序所得的60个COI基因和ITS序列构建系统发生树(ML、MP、NJ和贝叶斯树).结果表明,曲腿龟甲轮虫和热带龟甲轮虫间COI基因序列差异百分比为24.9％-26.5％,平均为25.7％.曲腿龟甲轮虫个体间序列差异百分比为0-2％,热带龟甲轮虫个体间序列差异百分比为0-1.5％.两种轮虫间ITS序列差异百分比为6.1％-7.6％,平均为7.25％.曲腿龟甲轮虫个体间序列差异百分比为0-1.1％,热带龟甲轮虫个体间序列差异百分比为0-0.7％.基于COI基因序列和ITS序列构建的四个系统树均支持曲腿龟甲轮虫单倍型和热带龟甲轮虫单倍型各自成支.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	席贻龙	安徽师范大学生命科学学院	96	907	16.0	24.0
2	许丹丹	安徽师范大学生命科学学院	6	25	3.0	5.0
3	余红宇	安徽师范大学生命科学学院	1	0	0.0	0.0