DNA条形码在淡水红藻中的应用评价——基于串珠藻科植物

• 作者: 冯佳 南方茹 吉莉 胡变芳 谢树莲 陈乐
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA条形码 串珠藻科 分子系统发育 红藻门
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 643-651
• 页数: 9页
• 分类号: Q949.29
• 字数: 664字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2017.82

摘要

研究采用4种DNA序列,分析了各片段序列特征以及在串珠藻科植物中种属水平的鉴定能力,包括线粒体COI-5P、cox2-3 spacer序列,以及叶绿体rbcL、UPA序列.结果表明,COI-5P、cox2-3 spacer、UPA以及rb-cL序列的PCR扩增成功率分别为96%、100%、96%和98%.其中,COI-5P、cox2-3 spacer和UPA的片段大小符合标准DNA条形码的判定标准,即片段大小在300—800 bp,能够通过单对引物双向测序获得.系统发育分析的结果显示,这4种DNA片段在串珠藻属植物的鉴定中能够鉴定大部分的种类,但COI-5P、cox2-3 spacer以及rbcL序列均不能将两种中国特有种洪洞串珠藻B.hongdongense和长柄串珠藻B.longipedicellatum与弧形串珠藻B.arcuatum分开.在种水平的鉴定中,UPA基因的种间差异最大,显示了较好的分离效果,在串珠藻科植物的鉴定中可以作为一个标准的DNA条形码.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢树莲	山西大学生命科学学院	183	1093	17.0	22.0
2	冯佳	山西大学生命科学学院	100	447	10.0	16.0
3	胡变芳	晋中学院生物科学与技术学院	30	46	3.0	5.0
4	陈乐	山西大学生命科学学院	4	7	2.0	2.0
5	吉莉	太原科技大学环境与安全学院	5	0	0.0	0.0
6	南方茹	山西大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0