紫扇贝、平濑掌扇贝与我国主养<em>4</em>种扇贝的亲缘关系分析

• 作者: 刘燕英 姜黎明 王力勇 胡丽萍 赵强
• 来源期刊: 齐鲁渔业
• 关键词: 紫扇贝 平濑掌扇贝 16S rRNA 遗传多样性 系统发生
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 语种: 中文

摘要

基于16S rRNA基因序列分析技术,对我国物种平濑掌扇贝、引进物种紫扇贝以及我国主养扇贝种类——栉孔扇贝、虾夷扇贝、海湾扇贝和华贵栉孔扇贝进行了遗传学比较分析和系统进化树构建.随机选取平濑掌扇贝4个个体,利用通用引物进行16S rRNA基因片段扩增及测序,获得长度为602 bp的序列片段,种内变异分析共检测到9个核苷酸变异位点,且均为核苷酸转换或者颠换,无插入/缺失类型.6种扇贝序列比对共检测到212个变异位点,其中简约信息位点99个,Singleton位点95个,插入和缺失位点为77个,既有转换或颠换,又有插入或缺失的位点59个.核苷酸变异值及遗传距离分析结果表明,紫扇贝与海湾扇贝间的核苷酸变异值(9.18％)以及遗传距离(0.099)均为最小,表明两者亲缘关系最近;与平濑掌扇贝种间核苷酸变异值(11.78％)以及遗传距离(0.140)最小的是栉孔扇贝,表明两者具有较近的亲缘关系.基于NJ、ML及MP方法构建的系统发生树结果一致,均为6种扇贝聚为2个大支,其中紫扇贝和海湾扇贝单独聚为一支,平濑掌扇贝与其它3种扇贝聚为另外一支.本研究结果将为国内扇贝的种质资源保护、引种及遗传育种工作提供一定的理论参考.