工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群多样性及菌群结构分析

• 作者: 任战军 孟繁臣 宋冰 宫瑞光
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 肉兔 野兔 盲肠 菌群多样性 菌群结构
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 25-30
• 页数: 6页
• 分类号: S811.5
• 字数: 4089字
• 语种: 中文

摘要

论文旨在分析工厂兔、散养兔和野兔的盲肠菌群多样性及菌群结构.收集工厂兔、散养兔和野兔各6只并采集盲肠内容物,提取盲肠内容物基因组DNA并对16S rDNA的V4-V5区进行HiSeq测序.结果表明:(1)工厂兔盲肠细菌种类数、盲肠菌群丰富度、盲肠菌群多样性指数均显著(P＜0.05)高于散养兔和野兔.(2)工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群结构相互之间差异显著(P＜0.05).(3)工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群的主要菌门为厚壁菌门(工厂兔为71.54％,散养兔为65.37％,野兔为63.25％)、拟杆菌门(工厂兔为23.78％,散养兔为30.8％,野兔为21.21％),野兔的特殊优势菌门为螺旋体门(12.36％).工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群的主要菌科均含瘤胃菌科(工厂兔为39.26％,散养兔为33.33％,野兔为29.16％)、毛螺菌科(工厂兔为23.04％,散养兔为28.47％,野兔为21.54％),散养兔的特殊优势菌科为理研菌科(19.75％),野兔的特殊优势菌科为螺旋体科(12.36％).在属水平上,工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群丰度最高的分别为拟杆菌属(9.45％)、理研菌科-RC9-gut-group(17.68％)、Sphaerochaeta (12.36％).综上,工厂兔、散养兔和野兔盲肠菌群结构差异显著(P＜0.05),但主要菌门均为厚壁菌门和拟杆菌门;工厂兔盲肠菌群多样性高于散养兔和野兔.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	任战军	西北农林科技大学动物科技学院	112	526	11.0	16.0
2	宫瑞光	西北农林科技大学动物科技学院	4	17	2.0	4.0
3	宋冰	西北农林科技大学动物科技学院	11	38	3.0	6.0
4	孟繁臣	西北农林科技大学动物科技学院	2	12	2.0	2.0