基于EST-SSR标记的贵州野生刺梨居群遗传多样性分析

• 作者: 安华明 张怀山 王道平 鄢秀芹 鲁敏
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 刺梨 SSR 遗传多样性 居群遗传结构
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 1098-1108
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2017.06.011

摘要

[目的]通过分析评价贵州野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源居群遗传多样性和遗传结构,为刺梨资源的保护和发掘利用提供科学依据.[方法]从刺梨EST-SSR引物中筛选扩增效果好、多态性较高的10对引物,对收集的12个野生刺梨自然居群(共255份资源)的遗传多样性及遗传结构应用POPGENE 1.31软件进行分析,并根据Nei's标准遗传距离,利用NTSYS-pc2.10e软件对各居群进行聚类分析,同时进行Nei’s遗传距离与地理距离的Mante1相关性检验.[结果]居群内Shannon信息指数(Ir)为0.62-0.88,基因多样性指数(Nei's)为0.40-0.52,且除福泉(FQ)和晴隆(QL)居群外,其余1 0个居群的多态位点百分率均为100％.此外,卡方检验显示1 2个居群在大多数位点上等位基因显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05),且居群内近交系数(Fit)、总近交系数(Fis)均为负值,居群间分化系数Fst平均值0.0403,居群间基因流Nem平均值为5.9484,遗传一致度GI为0.9068-0.9926,最大Nei's遗传距离为0.0978.各自然居群间Nei's遗传距离与地理距离存在显著相关性(r=0.2498,P=0.9512).[结论]10对EST-SSR引物具有高度的多态性,可作为有效的遗传标记用于刺梨居群遗传多样性和遗传结构评价.贵州省野生刺梨自然居群内的遗传多样性较高,存在杂合度过剩的现象,且绝大多数的遗传变异发生在居群内;居群间具有基因交流频繁、遗传一致度高、Nei's遗传距离小等特点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王道平	贵州省中国科学院天然产物化学重点实验室	86	549	11.0	18.0