意大利蝗转录组及性腺发育相关基因分析

• 作者: 于非 叶小芳 向敏 季荣 扈鸿霞 王伟亮 王晗 肖宏伟
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 意大利蝗 高通量测序技术 基因注释 卵巢 精巢
• 年，卷（期）: 2017,（11）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1235-1246
• 页数: 12页
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2017.11.001

摘要

[目的]意大利蝗Calliptamus italicus是新疆荒漠、半荒漠草原优势危害种类之一,其生殖相关基因信息缺乏.本研究对意大利蝗精巢和卵巢组织进行高通量转录组测序,旨在揭示意大利蝗转录组特征,并获得与性腺发育相关的基因数据.[方法]利用Illumina高通量测序平台(HiSeq/MiSeq)对意大利蝗进行了转录组测序,并进行序列分析.[结果]获得718 872条unigenes,平均长度631 bp,N50为1 186 bp.通过同源性比对,成功注释254 597条unigenes,其中,Nr数据库注释占28.87％,比例最高.Nr数据库注释的unigenes与黑褐草蚁Lasius niger的相似基因序列最多,为10.80％.与GO数据库比对发现,意大利蝗转录组unigene可分为3大类:涉及分子功能的unigenes有31 392条,涉及细胞组分的unigenes有20 586条,与生物学过程有关的unigenes有57 014条.KEGG pathways分析表明,23 666条unigenes归属于251个通路.涉及生殖系统发育的通路有卵母细胞减数分裂、胰岛素信号通路、Wnt信号通路、促性腺激素释放激素信号通路、转化生长因子β信号通路以及泛素介导的蛋白水解、黄体酮介导的卵母细胞成熟、昆虫激素生物合成等.进一步筛选得到部分与性腺发育相关的基因,包括vg,vgr,sox 21b,testis-specific serine/threonine-protein kinase,spermatogenesis-associated protein和vasa-like gene等.[结论]本研究获得了意大利蝗转录组数据及性腺发育相关基因,为进一步研究意大利蝗生殖调控机理奠定了分子基础.