桉树焦枯病菌CpSit1基因的鉴定与表达

• 作者: 丁奕 冯丽贞 刘宏毅 叶小真 李慧敏 杨泽慧 陈慧洁
• 来源期刊: 《福建农林大学学报（自然科学版）》
• 关键词: 桉树 焦枯病 铁载体转运蛋白 生物信息学分析 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 418-422
• 页数: 5页
• 分类号: S763.15
• 语种: 中文
• DOI: 10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2017.04.010

摘要

利用Blast及TCDB数据库对桉树焦枯病菌(Calonectria pseudoreteaudii)的Cpsit1基因进行鉴定;再利用SMART数据库和ProtParam、TMHMM、PHD、ProComp 9.0在线分析工具对Cpsit1基因编码蛋白的理化性质、跨膜螺旋、蛋白质二级结构和亚细胞定位进行预测分析;最后采用qRT-PCR方法对CpSit1基因在焦枯病菌侵染桉树过程中的表达情况进行分析.结果表明:CpSit1基因长度为1780 bp,其编码的蛋白序列共有592个氨基酸残基组成,并将其鉴定为铁载体-铁:H+同向转运蛋白.其保守结构域为MFS 1;共含有14个跨膜螺旋;在二级结构中 α 螺旋占45.10%,延伸链占26.01%,无规则卷曲占28.89%.通过qRT-PCR相对定量的方法分析焦枯病菌侵染桉树24、48和72 h后CpSit1基因的表达情况,结果显示,CpSit1基因在这3个时段均发生上调表达,但24 h的表达量明显大于48和72 h.说明桉树焦枯病菌CpSit1基因在病原菌侵染寄主的过程中通过调控铁载体-铁化合物的转运来完成铁元素的摄入,协助其在寄主中的定植.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯丽贞	福建农林大学林学院	45	532	12.0	22.0
2	陈慧洁	福建农林大学林学院	10	50	4.0	6.0
3	杨泽慧	福建农林大学林学院	6	6	2.0	2.0
4	叶小真	福建农林大学金山学院	23	77	5.0	7.0
5	刘宏毅	福建农林大学林学院	5	14	3.0	3.0
6	李慧敏	福建农林大学林学院	8	23	4.0	4.0
7	丁奕	福建农林大学林学院	3	3	1.0	1.0