百合S-RNase基因cDNA全长克隆及表达分析

• 作者: 丁榕 崔金腾 张克中 王杰 赵和文
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 百合 S-RNase基因 克隆 半定量
• 年，卷（期）: 2017,（9）
• 所属期刊栏目: 林学与园艺
• 页码范围: 649-655
• 页数: 7页
• 分类号: S682.29
• 语种: 中文

摘要

[目的]克隆百合S-RNase基因cDNA全长序列并进行表达信息分析,为百合不亲和机制的研究奠定基础.[方法]以东方百合(Lilium oriental)品种''Justina''为材料,通过RACE技术克隆百合S-RNase基因的cDNA全长序列;采用半定量RT-PCR技术对百合同一时期不同器官的S-RNase基因的表达量进行定性分析;并通过NCBI在线工具以及ProtParam、SignalP、MEGA5对其序列进行生物信息学分析.[结果]克隆基因全长为766 bp,开放阅读框为672 bp,推导编码223个氨基酸;其半定量分析显示表达量由高到低的器官依次为花瓣、叶、茎、大量分泌液时的花柱、无分泌液时的花柱、鳞茎.通过生物信息学分析发现,该蛋白为一个不稳定的亲水蛋白、存在信号肽序列,属于分泌型蛋白.具有典型的RNase T2家族蛋白保守结构域特征,二级结构富含环形结构.在已知的S-RNase基因中,与野茶树的亲缘关系最近.[结论]获得百合S-RNase基因cDNA全长序列及在同一时期不同器官的S-RNase基因的表达量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	崔金腾	北京农学院园林学院	36	148	6.0	11.0
4	张克中	北京农学院园林学院	48	632	15.0	24.0
7	赵和文	北京农学院园林学院	21	158	5.0	12.0
8	丁榕	北京农学院园林学院	5	10	2.0	3.0
21	王杰	北京农学院园林学院	5	68	3.0	5.0