基于线粒体COⅠ基因和控制区序列的辽宁沿海弯棘斜棘(鱼衔)群体遗传多样性和遗传结构分析

• 作者: 于旭光 付杰 刘修泽 李玉龙 李轶平 董婧
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 弯棘斜棘(鱼衔) 线粒体DNA COⅠ基因 控制区序列 遗传多样性 遗传分化
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 页码范围: 581-588
• 页数: 8页
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 4887字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2017.75

摘要

为研究辽宁沿海弯棘斜棘(鱼衔)(Repomucenus curvicornis)自然群体的遗传多样性及遗传结构,采用PCR扩增获得辽宁沿海弯棘斜棘(鱼衔)辽东湾群体(n=22)及黄海北部群体(n=18)线粒体的COⅠ及控制区(CR)部分DNA序列片段,进行序列比较及遗传多样性分析.获得弯棘斜棘(鱼衔)COⅠ基因片段624 bp,其A、T、C、G平均含量分别为24.09%、31.04%、25.28%和19.59%;CR片段460 bp,其A、T、C、G平均含量分别为32.96%、32.80%、14.86%和19.38%.基于COⅠ基因和CR序列得到的两群体变异位点数、平均核苷酸差异数、单倍型多样性指数以及核苷酸多样性指数分别为:38、4.67、0.96±0.02和0.0075±0.0042;26、3.35、0.97±0.02和0.0073±0.0043.序列分析结果均显示,辽东湾群体的遗传多样性低于黄海北部群体.分子方差(AMOVA)分析结果显示,基于COⅠ基因片段辽东湾与黄海北部群体间无明显遗传分化(Fst=0.0091,P=0.25)而基于CR序列两群体间具有较小但接近显著的遗传分化(Fst=0.0264,P=0.09).研究表明,线粒体CR序列与COⅠ基因均可作为检测弯棘斜棘(鱼衔)群体遗传多样性的有效分子标记,但CR序列遗传分化的敏感度要高于COⅠ基因,更适合作为弯棘斜棘(鱼衔)群体遗传研究的分子标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付杰	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	7	14	2.0	3.0
2	李玉龙	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	14	45	4.0	6.0
3	刘修泽	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	14	106	5.0	10.0
4	李轶平	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	15	81	5.0	8.0
5	于旭光	辽宁省海洋水产科学研究院辽宁省海洋生物资源与生态学重点实验室	8	37	3.0	6.0