基于转录组的芒果MYB家族基因的鉴定及分析

• 作者: 姚全胜 武红霞 王松标 罗纯 许文天 郑斌 马小卫
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 芒果 MYB家族基因 R2R3-MYB 生物信息学
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 1285-1294
• 页数: 10页
• 分类号: S667.7
• 字数: 4226字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2017.07.017

摘要

MYB家族作为植物中较大的转录因子家族之一,参与调控植物的多种生理活动.本研究基于芒果果实转录组测序结果,鉴定出71个MYB家族蛋白,其中包含1个4R-MYB蛋白、3个R1R2R3-MYB蛋白、60个R2R3-MYB蛋白和7个MYB相关蛋白.进化树及基序分析表明:除个别蛋白外,相同类型的MYB蛋白均聚在一起,且相近分支的MYB蛋白具有相同或相似的基序.60个全长MYB家族蛋白中,大部分为不稳定蛋白,且均为不含跨膜结构和信号肽的亲水性蛋白,亚细胞定位分析均定位于细胞核.进化树分析发现芒果R2R3-MYB蛋白与拟南芥有较高的保守性.R2R3-MYB蛋白保守域分析发现,R2和R3结构域均有多个氨基酸保守不变.GO分析发现芒果R2R3-MYB蛋白共注释到生物学过程、 细胞组分和分子功能3大类功能的15个亚类.