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普通烟草CESA基因家族成员的鉴定、亚细胞定位及表达分析
普通烟草CESA基因家族成员的鉴定、亚细胞定位及表达分析
作者:
孔英珍
徐宗昌
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
普通烟草
CESA基因家族
基因表达
亚细胞定位
摘要:
纤维素合成酶蛋白(cellulose-synthase proteins,CESA)是一类质膜定位蛋白,以蛋白复合体的形式存在于质膜上合成纤维素,在细胞壁建成和植物生长发育过程中起着非常重要的作用.本研究利用CESA蛋白保守域序列PF03552检索普通烟草(Nicotiana tabacum L.)蛋白序列,并通过拟南芥(Arabidopsis thaliana)10个CESA蛋白序列在普通烟草基因组数据库中利用TBLASTN程序进行比对,共获得21条NtCESA基因候选序列,对这些序列进行蛋白序列理化性质分析、系统进化树构建、基因结构分析、保守结构域及跨膜区分析和组织表达模式分析,并对NtCESA9和NtCESA14两个蛋白进行了亚细胞定位实验.结果表明:获得的21条NtCESA蛋白序列的理化性质相似;系统进化分析将21个NtCESA基因和10个AtCESA基因分成5个分支,每一个分支各成员之间的进化相对保守,基因结构类似,不同分支之间的基因结构差异也较小;NtCESA蛋白结构域相对保守,都含有CESA蛋白典型的N端锌指结构、C端跨膜区和DDD-QXXRW保守功能域;组织表达分析结果表明,大部分NtCESA基因在幼苗和成熟期烟草的根、叶、胚芽和愈伤组织中都有表达,同一个分支中的基因表达模式基本一致,并且NtCESA基因参与初/次生细胞壁纤维素的合成与该基因编码蛋白的跨膜区数目存在关联,表明NtCESA基因家族成员功能上的复杂性;亚细胞定位结果证实NtCESA9和NtCESA14为质膜定位蛋白.本研究为烟草CESA基因家族功能的深入研究奠定了基础.
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烟草
主脉组织
Hsp70基因家族
生物信息学
NtHsp70Chl
高温诱导
内容分析
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期刊文献
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关键词热度
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文献信息
篇名
普通烟草CESA基因家族成员的鉴定、亚细胞定位及表达分析
来源期刊
遗传
学科
关键词
普通烟草
CESA基因家族
基因表达
亚细胞定位
年,卷(期)
2017,(6)
所属期刊栏目
研究报告
研究方向
页码范围
512-524
页数
13页
分类号
字数
7896字
语种
中文
DOI
10.16288/j.yczz.16-428
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
孔英珍
中国农业科学院烟草研究所中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室
6
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3.0
4.0
2
徐宗昌
中国农业科学院烟草研究所中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室
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研究主题发展历程
节点文献
普通烟草
CESA基因家族
基因表达
亚细胞定位
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
遗传
主办单位:
中国遗传学会
中国科学院遗传与发育生物学研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9772
CN:
11-1913/R
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号院
邮发代号:
2-810
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
3898
总下载数(次)
19
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