利用RNA-seq技术筛选大白猪皮下和肌内脂肪组织差异表达基因

• 作者: 张秀秀 李嫒 苗向阳 黄万龙
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 肌内脂肪 皮下脂肪 脂质代谢 MAPK信号通路 猪 RNA-seq
• 年，卷（期）: 2017,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 501-511
• 页数: 11页
• 字数: 7024字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.17-038

摘要

为了比较分析大白猪皮下和肌内脂肪组织的全转录组数据,探究调控脂肪沉积的分子机制,本文采用RNA-seq技术和生物信息学方法鉴定大白猪皮下和肌内脂肪组织基因表达谱,对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)分析、信号通路富集分析以及蛋白互作网络分析.大白猪皮下和肌内脂肪组织中有180个基因差异表达,上调基因主要参与细胞增殖、脂质激酶活性和磷脂代谢等与脂质代谢相关的生物学过程正调控,下调基因显著富集于脂肪细胞分化中起重要调控作用的MAPK信号转导通路.差异表达基因主要通过参与脂质代谢及通过MAPK信号转导通路调控脂肪细胞成脂分化,进而影响大白猪皮下和肌内脂肪的沉积.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	苗向阳	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	71	407	11.0	16.0
2	张秀秀	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	7	33	3.0	5.0
3	黄万龙	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	6	30	3.0	5.0
4	李嫒	中国农业科学院北京畜牧兽医研究所	4	26	3.0	4.0