基于磁珠富集法开发并筛选西川红景天的微卫星标记

• 作者: 张发起 王久利 陈世龙 雷淑芸
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 西川红景天 微卫星 引物 磁珠富集法 开发
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 植物生态与生物多样性
• 页码范围: 342-347
• 页数: 6页
• 分类号: Q941|Q948
• 字数: 4434字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201603025

摘要

利用FIASCO磁珠富集法,开发和筛选青藏高原特有珍贵植物西川红景天(Rhodiola alsia)多态性微卫星标记.结果表明:用(AG)15和(AC)15两种微卫星标记探针构建富集文库,共获得阳性克隆约2 500个;从中随机挑取1200检测,发现具有多态性的阳性克隆达400个;随机挑取200多态性的阳性克隆进行测序,从中获得105个SSR位点,用在线软件primer3-2.3.4成功设计得SSR引物105对;其中45对可以成功扩增,而13对所扩增的片段在相距较远的4个自然居群的24个个体中显示较高的遗传多态性.用4个居群的80个个体检测这13对引物发现,平均等位基因数(A)约为9.192,观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)均值分别约为0.712和0.734,如此高的多态性已经满足后期研究的需要;数个位点在某些居群中显著偏离哈迪温伯格平衡(P<0.01),这可能是实际研究的居群并不能达到哈迪-温伯格定律所假设的无限大等理想状态所致.结合此前基于表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)序列开发的SSR多态性位点,该研究结果为今后利用SSR位点开展西川红景天的居群遗传结构分析和其他研究提供了一组有效工具.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张发起	中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所	10	17	2.0	4.0
2	陈世龙	中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所	20	103	7.0	10.0
3	王久利	中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所	6	12	2.0	3.0
7	雷淑芸	中国科学院高原生物适应与进化重点实验室中国科学院西北高原生物研究所	2	3	1.0	1.0