基于ITS序列分析钩苞大丁草九个居群的亲缘关系

• 作者: 徐晓丹 王炜 王谈笑 郑伟 陈菁
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 钩苞大丁草 ITS序列 居群 遗传距离 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 植物生态与生物多样性
• 页码范围: 329-334
• 页数: 6页
• 分类号: Q948.5
• 字数: 3904字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11931/guihaia.gxzw201609020

摘要

该研究对我国西南地区钩苞大丁草(Gerbera delavayi) 9个居群rDNA ITS序列进行PCR的扩增和检测序列,并以非洲菊(G.jamesonii)的ITS序列作为外类群,比较了序列之间的差异,同时分析了钩苞大丁草不同居群在地理距离与遗传距离之间的关系,构建了NJ系统发育树.结果表明:(1)钩苞大丁草9个居群的ITS序列全长介于600~700 bp之间,平均长度约为657 bp,其中,ITS1长度为243~246 bp,(G+C)含量为45.67%~46.80%之间,5.8S长度191~193 bp,(G+C)含量为58.60%~58.61%之间,ITS2长度为220~221 bp,(G+C)含量为57.00%~57.45%之间;ITS序列共有22个变异位点,ITS1序列(17个)、5.8S序列(2个)以及ITS2序列(3个)上均有变异.(2)地理距离与遗传距离有正相关(r2=0.652),序列间遗传分化距离为0.001 1~0.024 3,其中普洱居群与其他居群间遗传距离最大.(3)钩苞大丁草9个居群分成三个分支,普洱居群单独成支,丽江和洱源居群聚为一支,富源、武定、德昌、石林、新平和开远6个居群聚为一支.rDNA ITS序列可以用于钩苞大丁草群体遗传研究的分析,该研究结果为其保护性开发提供了参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑伟	昆明理工大学建筑与城市规划学院	15	138	5.0	11.0
2	王炜	昆明理工大学建筑与城市规划学院	5	17	3.0	4.0
3	徐晓丹	昆明理工大学艺术与传媒学院	5	19	3.0	4.0
4	陈菁	昆明理工大学现代农业工程学院	5	19	3.0	4.0
5	王谈笑	昆明理工大学现代农业工程学院	4	17	3.0	4.0