基于SNP标记的黄瓜遗传多样性分析

• 作者: 夏建明 姚丹青 张微微 朱文莹 楼坚锋
• 来源期刊: 上海农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 黄瓜 遗传多样性 SNP标记 高分辨率溶解曲线 焦磷酸测序
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子遗传学
• 页码范围: 21-30
• 页数: 10页
• 分类号: S642.2
• 字数: 4334字
• 语种: 中文
• DOI: 10.15955/j.issn1000-3924.2017.01.04

摘要

通过查询NCBI、葫芦科基因组网站数据库获得42个黄瓜候选SNP位点.应用高分辨率溶解曲线技术对71个市售黄瓜品种进行SNP位点筛选,并通过焦磷酸测序进行SNP基因分型分析,探索SNP标记在黄瓜品种鉴定中的应用前景.结果表明:42个SNP位点中有30个位点的多态信息量为0.027-0.528,平均为0.247;71个黄瓜品种两两间的遗传相似系数分布在0.4032-0.9839,即30个SNP位点的基因分型数据信息可以将71份黄瓜品种区分开.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚丹青		21	29	3.0	4.0
2	楼坚锋		19	31	3.0	4.0
3	张微微		8	28	3.0	5.0
4	夏建明		5	11	1.0	3.0
5	朱文莹	上海交通大学农业与生物学院	3	18	3.0	3.0