江浙沪地区乙肝病毒B、C基因型S基因突变及选择压力分析

• 作者: 余景璐 崔大伟 陈海江 陈瑜
• 来源期刊: 中国微生态学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 乙肝病毒 S基因 α决定簇突 选择压力 氨基酸置换熵值
• 年，卷（期）: 2017,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 771-775,781
• 页数: 6页
• 分类号: R734.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13381/j.cnki.cjm.201707007

摘要

目的 系统分析江浙沪三地的乙肝病毒B、C基因型S基因突变和选择压力情况,以期为乙型肝炎的防治提供理论依据.方法 采用NCBI数据库提供的乙肝病毒序列,分为B、C基因型两组,分析突变情况,同时采用Datamonkey进行选择压力分析和Bioedit进行氨基酸置换熵值分析.结果 S基因226个氨基酸位点突变分析中,产生突变有位点122个,位点突变率C基因型(45.58％)高于B基因型(30.09％)(x2=11.523,P=0.001);总突变率C基因型(1.36％)高于B基因型(0.80％) (x2=46.642,P=0.000);α决定簇突变率C基因型(2.40％)高于B基因型(0.96％) (x2=20.524,P=0.000).B基因型α决定簇突变率高于总突变率(x 2=0.735,P=0.391);C基因型α决定簇突变率高于总突变率(x2=44.467,P=0.000).B基因型氨基酸突变最多的位点为200、213、161和21位点,C基因型氨基酸突变最多的位点为126、68、3、53和194位点.两个基因型dN/dS均值均小于1.B基因型没有发现正向选择位点,发现8个负向选择位点.C基因型发现7个正向选择位点,17个负向选择位点.B基因型仅发现一个易突变位点(200位),C基因型也仅发现一个易突变位点(126位),大多数氨基酸位点熵值＜0.4.结论 江浙沪地区S基因突变率水平较低,其中C基因型位点突变率、α决定簇突变率和总突变率高于B基因型,α决定簇突变率高于总突变率.C基因型经历外界环境免疫选择压力和自身进化压力双重影响,自身进化压力强于外界环境免疫选择压力;而B基因型主要遭受自身进化压力.尤其要格外关注C基因型的进化进程.