大麦白化颖壳突变体的转录组学分析

• 作者: 乔海龙 张英虎 栾海业 沈会权 申玉香 臧慧 陈和 陶红
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 大麦 白化颖壳突变体 转录组测序 差异基因
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 2332-2339
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2017.12.2332

摘要

为了探究大麦白化颖壳突变体形成机理,以白化颖壳突变体(AL)和野生型植株(WT)为试验材料,对2份材料抽穗期的颖壳进行转录组测序分析,通过Illumina HiSeqTM2500高通量转录组测序技术分别从WT和AL中获得2.7 Gb和4.1 Gb有效数据,拼接组装后得到64 634条通用基因(unigenes),其中长度大于1 kb的有23 696条.通过对2份材料间差异基因的筛选,共得到672个差异表达基因(DEGs),其中139个上调表达,533个下调表达.GO功能富集分析发现,在分子功能类型中注释的差异基因主要与叶绿体相关;KEGG显著富集分析发现差异基因广泛涉及碳代谢、光合作用等调控途径.对其中6个相关基因进行了RT-qPCR验证,表达趋势与RNA-Seq测序结果一致.表明AL的形成可能是由于叶绿体形成和发育相关基因的表达受到抑制,进一步导致了光合作用的下降,该研究结果对深入探究大麦的白化形成机理具有重要的参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	臧慧		38	221	8.0	13.0
2	沈会权		59	401	11.0	17.0
3	陶红		51	331	10.0	15.0
4	乔海龙		48	383	10.0	17.0
5	栾海业		20	50	4.0	6.0
6	张英虎		10	23	3.0	4.0
7	申玉香		3	10	1.0	3.0