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点蜂缘蝽触角转录组及化学感受相关基因的分析
点蜂缘蝽触角转录组及化学感受相关基因的分析
作者:
孙会忠
宋月芹
胡振杰
董钧锋
陈庆霄
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
点蜂缘蝽
触角转录组
高通量测序
基因注释
化学感受相关基因
摘要:
[目的]点蜂缘蝽Riptortus pedestris主要为害豆科作物,成虫和若虫刺吸汁液,造成严重损失,目前对该虫的研究较少,基因信息缺乏.本研究旨在获得点蜂缘蝽的触角转录组数据,开发基于嗅觉防治害虫的新方法.[方法]利用Illumina HiSeqTM 4000高通量测序技术测定了点蜂缘蝽成虫触角转录组,并进行了生物学信息分析.[结果]共获得45 802 812条clean reads,包括6.87 Gb(GenBank登录号:SRR4429103).拼接92 259条unigenes,平均长度为618 bp,N50为1 013 bp.在7大数据库中注释到21 365条unigenes.通过进一步转录组数据分析,我们鉴定出219个点蜂缘蝽化学感受相关基因,包括188个嗅觉受体、6个味觉受体、2个离子型受体、4个感觉神经元膜蛋白、8个气味结合蛋白和11个化学感受蛋白.氨基酸序列分析发现,RpedOBP1和RpedOBP2在第6个保守的半胱氨酸后又多了3个保守的半胱氨酸位点,属于加Plus-C气味结合蛋白家族.[结论]本研究获得了点蜂缘蝽触角转录组数据,并鉴定出嗅觉相关基因,结果为今后利用嗅觉基因靶标防治点蜂缘蝽提供了重要的分子生物学信息数据.
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篇名
点蜂缘蝽触角转录组及化学感受相关基因的分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
点蜂缘蝽
触角转录组
高通量测序
基因注释
化学感受相关基因
年,卷(期)
2017,(10)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
1120-1128
页数
9页
分类号
Q966
字数
语种
中文
DOI
10.16380/j.kcxb.2017.10.003
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
宋月芹
河南科技大学林学院
48
236
7.0
12.0
2
董钧锋
河南科技大学林学院
42
292
8.0
14.0
3
孙会忠
河南科技大学林学院
63
388
11.0
15.0
4
陈庆霄
河南科技大学林学院
7
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2.0
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胡振杰
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节点文献
点蜂缘蝽
触角转录组
高通量测序
基因注释
化学感受相关基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
49239
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