八氢番茄红素脱氢酶的分子结构及其与达草灭相互作用分析

• 作者: 李圆圆 白林含 邓鹏程 黄国周
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 八氢番茄红素脱氢酶 达草灭 分子动力学模拟 抗性
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 874-880
• 页数: 7页
• 分类号: Q518|Q811
• 字数: 4195字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0490-6756.2017.04.035

摘要

八氢番茄红素脱氢酶(Phytoene desaturase,PDS)是除草剂达草灭的靶点,作者对野生型和两种定点突变型PDS的二维和三维结构进行预测,并通过DOCK6.5进行PDS与达草灭的分子对接比较,利用Gromacs进行分子动力学模拟,使用Amber9中的mm_pbsa.pl分析能量分布及变化,使用LIGPLOT+软件进行氢键分析确认结合氨基酸位点.结果表明突变对二维和三维结构无影响,但是在达草灭存在的情况下,突变的PDS有更高的结合能以及更弱的结合稳定性,更难以与达草灭结合,找到突变PDS蛋白对达草灭具有抗性的分子证据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	白林含	四川大学生命科学学院资源与生态环境教育部重点实验室	31	170	8.0	11.0
2	黄国周	四川大学生命科学学院资源与生态环境教育部重点实验室	1	1	1.0	1.0
3	李圆圆	四川大学生命科学学院资源与生态环境教育部重点实验室	2	10	1.0	2.0
4	邓鹏程	四川大学生命科学学院资源与生态环境教育部重点实验室	1	1	1.0	1.0