CODEHOP设计简并引物克隆花羔红点鲑肌钙蛋白及其生物信息分析

• 作者: 巴翠玉 李月红 焦雪 茆安婷
• 来源期刊: 黑龙江水产
• 关键词: 花羔红点鲑 简并引物 CODEHOP 肌钙蛋白
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 科学试验
• 页码范围: 33-36
• 页数: 4页
• 字数: 2097字
• 语种: 中文

摘要

本实验通过无性生殖的方法得到了花羔红点鲑肌钙蛋白(Tnc)基因,并在使用生物信息学资源和生物软件的条件下,通过CODEHOP的方法对特定的氨基酸序列设计简并引物,并对得出的结果进行同源性分析同时构建其相对系统进化树.结果表明:通过CODEHOP的方法所设计出的引物简并度较其他方法得到的引物简并度低,DNA熔解温度(Tm值)修改较方便,产物具有较强的特异性;肌钙蛋白具有高度的保守性,将肌钙蛋白基因片断做结果比对,其编码的氨基酸序列与斑马鱼同源性可达96％,与大西洋鲑Salmo salar同源性为92％,白斑狗鱼Esoxlucius同源性为92％,虹鳟Oncorhynchus mykiss同源性为91％,斜带石斑鱼Epinepheluscoioides同源性为91％,斑点叉尾鮰Ictalurus punctatus同源性为85％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李月红	吉林农业大学动物科技学院实验室	86	353	8.0	16.0
2	焦雪	吉林农业大学动物科技学院实验室	12	12	2.0	2.0
3	巴翠玉	吉林农业大学动物科技学院实验室	15	30	2.0	4.0
4	茆安婷	吉林农业大学动物科技学院实验室	12	9	1.0	3.0