骨质疏松症易感基因BDNF的遗传学关联分析及功能研究

• 作者: 卢冰婕 杨熳 段媛媛 郭燕 陈晓峰 马建岗
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 关联分析 单核苷酸多态性 BDNF 骨质疏松症 成骨分化
• 年，卷（期）: 2017,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 726-736
• 页数: 11页
• 字数: 6223字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16288/j.yczz.17-145

摘要

为探索脑源性神经营养因子BDNF基因与中国汉族人群骨密度(bone mineral density,BMD)的关系,解析该基因调节骨质疏松症的功能机制,进而为中国汉族人群的骨质疏松症的防治提供依据.本研究从我国陕西地区征集了1300例汉族样本,并测量髋部/脊椎骨密度.选取BDNF基因上的14个标签SNPs进行基因分型,与1300例样本BMD进行关联分析,发现8个SNPs与髋部/脊椎BMD显著关联(P＜0.05).其中,SNP rs16917237同时与髋部和脊椎骨密度关联,经Bonferroni校正后仍表现出显著性(0.05/14=0.0036).整合连锁不平衡和单体型分析、表观功能注释、表达数量基因座分析、代谢通路分析进一步探索BDNF基因调节骨质疏松症的机制.构建小鼠前成骨细胞系(MC3T3-E1)人骨形态形成蛋白(rhBMP-2)诱导分化模型,利用小干扰RNA(siRNA)敲除BDNF.结果显示:14个SNPs位于同一单体型内;rs16917237在成骨细胞中表现出较强的激活型组蛋白H3K4mel、H3K4me3、H3K27ac修饰信号以及P300结合信号,表明其在成骨细胞中可能具有调控活性;rs16917237在11个组织中均能显著影响BDNF基因表达;BDNF基因位于与成骨细胞增殖分化相关的MAPK通路中;BDNF敲低能够显著降低MAPK通路中与成骨分化相关的CREB基因mRNA和蛋白表达水平,提示其可能通过调控CREB表达进而影响成骨分化.生物信息学分析和功能实验结果一致,表明BDNF基因可能是影响骨质疏松症的重要功能基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭燕		18	99	5.0	9.0
2	马建岗	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	18	132	5.0	11.0
3	陈晓峰	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	3	3	1.0	1.0
4	杨熳	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0
5	卢冰婕	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	1	3	1.0	1.0
6	段媛媛	西安交通大学生命科学与技术学院生物医学信息工程教育部重点实验室	2	3	1.0	1.0