基于转录组和基因表达谱的葱蝇分泌组挖掘及其在滞育发育中的可能作用分析

• 作者: 徐燕玲 郝友进 陈斌
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 葱蝇 滞育 分泌蛋白 转录组 数字基因表达谱 RNA-seq
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 1168-1177
• 页数: 10页
• 分类号: Q966
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2017.10.007

摘要

[目的]昆虫滞育是一种重要的季节性适应生存的环境生理现象,但是调控葱蝇Delia antiqua夏滞育和冬滞育的分子机理却知之甚少.本研究旨在鉴定与葱蝇蛹滞育相关的候选基因.[方法]利用RNA-seq和数字基因表达谱数据,通过生物信息学的方法预测分析葱蝇滞育相关的分泌蛋白,并进行了氨基酸序列相似性、基本理化性质分析;从表达谱中选取12个差异表达基因,利用qRT-PCR验证了它们在非滞育蛹以及夏滞育和冬滞育蛹的不同发育时期的表达特点.[结果]共鉴定出38个在葱蝇夏滞育蛹和冬滞育蛹之间差异表达的可能的分泌蛋白.同源基因注释表明,这些基因可能在气味分子结合、几丁质和脂类代谢、免疫及发育等方面发挥作用,其中脂类和几丁质代谢过程的调节似乎在滞育发育过程起到重要作用.qRT-PCR分析结果表明,12个被选择基因的表达谱与RNA-seq结果相吻合(R =0.862,P=0.001).[结论]本研究为基于高通量测序的分泌组挖掘及滞育相关基因的鉴定提供了强有力地分析策略.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈斌	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	73	290	9.0	15.0
2	郝友进	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	19	52	5.0	6.0
3	徐燕玲	重庆师范大学昆虫与分子生物学研究所媒介昆虫重庆市重点实验室	3	7	2.0	2.0