基于TCGA数据集探讨FAT2基因在上皮性卵巢癌中的作用及机制

• 作者: 张琴 杨丽华 翟惠惠 赵洪波
• 来源期刊: 天津医药
• 关键词: 卵巢肿瘤 上皮性卵巢癌 FAT2 Wnt信号通路 cbioprotal genecards
• 年，卷（期）: 2017,（12）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 1289-1292
• 页数: 4页
• 分类号: R737.31
• 语种: 中文
• DOI: 10.11958/20170801

摘要

目的 基于肿瘤基因图谱(TCGA)数据集研究脂肪非典型钙黏蛋白2(FAT2)基因在卵巢癌中的表达情况,预测并分析FAT2在卵巢癌发生发展中的可能机制及临床价值.方法 应用cbioprotal在线分析平台分析TCGA数据库中311例上皮性卵巢癌RNA-SEQ数据,并结合患者的完整生存期信息,采用Kaplan-Meier法分析FAT2变异与卵巢癌患者生存之间的关系.应用genecards数据库收集与FAT2基因相关的蛋白,绘制FAT2相关蛋白网络图,对相关蛋白进行富集分析,分析蛋白富集的信号通路、生理过程及关键下游基因.结果 311例卵巢癌样本中有12例发生FAT2基因变异,变异率为4%,扩增7例(2.3%),错义突变3例(1%),缺失2例(0.6%).Kaplan-Meier生存曲线分析表明,FAT2变异组总生存时间长于无变异组(P=0.0338),无病生存时间与无变异组差异无统计学意义(P=0.387).与FAT2相关的蛋白有CTNNB1、ARVCF、CTNND1等21个,其中CTNNB1蛋白在卵巢癌中低表达,相关蛋白富集分析到Wnt信号通路、细胞黏附等细胞生理活动.结论 FAT2基因可能可通过诱导Wnt通路中的关键蛋白CTNNB1降解发挥抑癌基因的作用.卵巢癌组织中FAT2高表达是一种预后良好指标,可作为预测患者生存时间,判断预后的有效生物标志物.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨丽华	昆明医科大学第二附属医院妇科	69	195	7.0	10.0
2	张琴	昆明医科大学第二附属医院妇科	25	38	3.0	4.0
3	赵洪波		10	18	2.0	3.0
4	翟惠惠	昆明医科大学第二附属医院妇科	1	1	1.0	1.0