番茄qRT-PCR内参基因的筛选

• 作者: 余文贵 周蓉 姜静 李亚茹 王银磊 赵丽萍 赵统敏
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 实时荧光定量PCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 园艺
• 页码范围: 389-396
• 页数: 8页
• 分类号: S641.2
• 字数: 5002字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2017.02.024

摘要

以高温、低温、盐胁迫、TYLCV接种处理和对照的番茄幼苗为植物材料,通过实时荧光定量RT-PCR(Real-time fluorescence quantitative PCR,qRT-PCR)方法分析了常用的8个内参基因肌动蛋白基因(ACT)、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH)、泛素基因(UBI)、18S核糖体RNA基因(18S)、转录延伸因子基因(EF-1a)、β-微管蛋白基因(TUB)、表达蛋白基因(EXP)和接合素蛋白复合物基因(CAC)在不同样本中的表达情况.利用geNorm和NormFinder软件分析筛选表达稳定性较高的内参基因.结果表明,在不同胁迫处理条件下,UBI和ACT的稳定性较高;在同样的胁迫处理中,8个内参基因的表达稳定性不同.综合而言,虽然UBI和ACT的稳定性同样较高,但在TYLCV接种处理试验中ACT的稳定性相对较差,而TUB和GAPDH表达较稳定,故TUB和GAPDH可在TYLCV接种处理试验中作为番茄qRT-PCR的内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵统敏	江苏省农业科学院蔬菜研究所	78	744	14.0	25.0
2	余文贵	南京农业大学园艺学院	61	610	14.0	22.0
4	赵丽萍	江苏省农业科学院蔬菜研究所	45	350	9.0	17.0
5	王银磊	江苏省农业科学院蔬菜研究所	25	83	5.0	7.0
6	周蓉	江苏省农业科学院蔬菜研究所	3	5	1.0	2.0
7	姜静	南京农业大学园艺学院	2	5	1.0	2.0
11	李亚茹	江苏省农业科学院蔬菜研究所	2	5	1.0	2.0