DNA条形码专用R包及其主要功能简介

• 作者: 张爱兵 罗桂杰 金倩 阮倩倩 陈芬
• 来源期刊: 环境昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: DNA条形码 R语言 SPIDER BarcodingR
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 特邀稿件
• 页码范围: 485-492
• 页数: 8页
• 分类号: Q963
• 字数: 3820字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-0858.2017.03.1

摘要

SPIDER和BarcodingR软件包作为DNA条形码研究的专用R软件包,整合了基于DNA条形码的物种识别算法和数据分析策略,避免了各种非商业用途软件的局限性,为DNA条形码的研究提供了便捷性和可操作性.本文对SPIDER和BarcodingR软件包的主要功能进行整体介绍,并以西藏夜蛾科COI、松毛虫属ITS等数据为例,进行主要函数的演示分析,希望为昆虫DNA条码的应用分析提供帮助.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	金倩	江苏省农业科学院宿迁农科所	14	14	2.0	3.0
3	张爱兵	首都师范大学生命科学学院	21	194	8.0	13.0
4	阮倩倩	江苏省农业科学院宿迁农科所	12	13	2.0	3.0
7	陈芬	江苏省农业科学院宿迁农科所	19	36	4.0	5.0
8	罗桂杰	江苏省农业科学院宿迁农科所	18	19	3.0	3.0