鲤疱疹病毒3型焦磷酸测序检测方法的建立

• 作者: 刘春 曾伟伟 李莹莹 王庆 王英英 石存斌 郑树城
• 来源期刊: 生物学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲤疱疹病毒3型 锦鲤疱疹病毒 焦磷酸测序 检测
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 技术方法
• 页码范围: 95-98
• 页数: 4页
• 分类号: Q78
• 字数: 3269字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1736.2017.03.095

摘要

为了针对鲤疱疹病毒3型(Cyprinid herpesvirus 3,CyHV-3)建立一种基于焦磷酸测序技术的高通量、自动化、快速的检测方法,根据CyHV-3 ORF55、ORF79和ORF92基因保守区域设计特异性PCR扩增引物和测序引物,进行PCR扩增筛选扩增效率最高的引物.PCR灵敏性和特异性试验结果显示,针对ORF79设计的引物扩增效率最高,最低检测量为100个拷贝数,且能特异性识别CyHV-3;将PCR产物进行焦磷酸测序,获得的序列经BLAST比对显示与CyHV-3-U、I、J和GZ11分离株一致性均为100%.该检测方法方便快速,适用于出入境口岸大批量样品CyHV-3诊断检测.