草莓FaCOP1的克隆及其表达特异性分析

• 作者: 冯琛 叶云天 孙勃 张云婷 江雷雨 汤浩茹 王小蓉
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 FaCOP1 生物信息学分析 表达特异性 光质 光形态建成
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 547-556
• 页数: 10页
• 分类号: S668.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2016-0628

摘要

为探索草莓光形态建成抑制子FaCOP1的功能及其表达特异性,采用同源克隆法获得‘丰香’草莓FaCOP1的完整开放阅读框序列,对该序列及其编码的氨基酸序列进行相关生物信息学分析,同时采用qRT-PCR分析该基因的时空表达以及在不同光质处理下的表达模式.结果表明,FaCOP1开放阅读框全长1 989 bp,GenBank登录号为KX583676,编码662个氨基酸,蛋白质分子量为74.7187kD,理论等电点为6.54,具有环形锌指域,卷曲螺旋域和WD40重复序列等3个保守结构域.序列比对以及系统进化树分析发现,COP1进化过程中具有高度保守性以及物种间的差异性.qRT-PCR结果表明,FaCOP1在草莓的根、茎、叶、花及成熟果实中均有表达,花中的表达量最高,其次是叶和根,而茎和成熟果实中最少.随着草莓果实的发育(从小绿期到全红期)FaCOP1的转录水平总体呈现递减的规律,与果实花青素积累模式相反.草莓叶片和果实的FaCOP1表达均能够被白、红、蓝及红蓝光(1∶1)诱导.FaCOP1在转录水平上没有阻遏FaHY5的表达,其关系需在蛋白质水平上进一步验证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汤浩茹	四川农业大学园艺学院	150	2302	23.0	42.0
2	王小蓉	四川农业大学园艺学院	51	624	16.0	23.0
6	张云婷	四川农业大学园艺学院	11	59	4.0	7.0
7	江雷雨	四川农业大学园艺学院	13	22	2.0	4.0
8	孙勃	四川农业大学园艺学院	26	79	6.0	8.0
9	冯琛	四川农业大学园艺学院	9	19	2.0	4.0
10	叶云天	四川农业大学园艺学院	11	10	2.0	3.0