梨属植物SSR分子标记核心引物的筛选及其聚类分析

• 作者: 李秀根 杨健 温晶晶 王磊 王苏珂 王龙 苏艳丽 薛华柏 赵瑞娟
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 梨 SSR核心引物 遗传多样性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 1229-1238
• 页数: 10页
• 分类号: S661.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20170099

摘要

[目的]筛选适合梨种质资源遗传多样性研究、品种鉴定分析的SSR核心引物.[方法]利用来源于不同系统、遗传背景差异较大的12份梨种质资源对已报道的800对梨和苹果的SSR引物和本课题组开发的534对SSR引物进行初步筛选,再利用48份不同地理来源的梨种质资源对初筛引物进行复筛,筛选一套适合梨种质资源遗传多样性研究、系统发育和品种鉴定分析的SSR核心引物,并通过遗传多样性分析和聚类分析验证引物的有效性.[结果]初筛出SSR引物131对,进一步复筛筛选出25对清晰稳定、多态性高的核心引物.25对核心引物对48份梨种质资源进行遗传多样性分析,共得到387个等位基因,平均每个位点等位基因数15.48个.各位点杂合度变幅为0.44～0.92,均值0.76;多态性信息含量变幅为0.70～ 0.92,均值0.85;基因多样性变幅为0.73～0.92,均值为0.87,说明引物的多态性高,能够有效揭示48份梨种质资源的遗传多样性.48份梨种质资源的聚类分析结果显示,西洋梨和东方梨分别聚成了2个类群,东方梨类群中的栽培种和野生种分别聚成了2个亚群;栽培种中的秋子梨品种聚在了一起,白梨和砂梨聚在了一起.[结论]筛选出的25对梨SSR引物,带型清晰、稳定,多态性信息含量均在0.70以上,可作为核心引物用于梨种质资源鉴定和遗传多样性分析等研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨健	中国农业科学院郑州果树研究所	81	416	11.0	18.0
2	李秀根	中国农业科学院郑州果树研究所	111	927	17.0	27.0
3	王磊	中国农业科学院郑州果树研究所	169	1864	23.0	36.0
4	薛华柏	中国农业科学院郑州果树研究所	46	195	9.0	13.0
5	王龙	中国农业科学院郑州果树研究所	60	234	8.0	13.0
6	王苏珂	中国农业科学院郑州果树研究所	34	112	4.0	10.0
7	苏艳丽	中国农业科学院郑州果树研究所	30	75	6.0	7.0
8	赵瑞娟	中国农业科学院郑州果树研究所	1	0	0.0	0.0
9	温晶晶	中国农业科学院郑州果树研究所	1	0	0.0	0.0