基于转录组测序对翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)2种肌球蛋白重链基因的克隆与分析

• 作者: 叶星 孙成飞 田园园 董浚键 陈之航
• 来源期刊: 渔业科学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 翘嘴鳜 转录组测序 肌球蛋白重链 cDNA克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 51-61
• 页数: 11页
• 分类号: S917.4
• 字数: 8104字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11758/yykxjz.20160414001

摘要

肌球蛋白重链(Myosin heavy chain,MYH)是骨骼肌粗肌丝的重要组成单位,其表达量高低影响肌纤维的组成和肌肉生长.为了解其在翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)早期生长过程中的作用,本研究从前期生长差异显著的2组(快长组和慢长组)翘嘴鳜幼鱼转录组差异表达Unigene中筛选出2个MYH基因,RACE (Rapid amplification of cDNA ends)克隆到其全长cDNA(MYH-7a,MYH-7b).MYH-7a全长为6071bp,开放阅读框为5820 bp;MYH-7b全长为5896 bp,开放阅读框为5745 bp.序列分析显示,2个MYH均有Loopl、Loop2环、ATP结合位点等关键结构域;进化树聚类分析显示,MYH-7a与MYH-7b均属于慢肌球蛋白.实时荧光定量PCR验证发现,其在快长组样本中表达量显著高于慢长组,与转录组测序结果一致;检测其在翘嘴鳜心肌、红白肌和皮肤等14种组织的表达水平,结果显示,MYH-7a主要在心肌中表达,而MYH-7b主要在红肌中表达;在胚胎发育不同阶段,二者随着胚胎发育的进行,表达量不断增加;在幼鱼早期生长过程(孵化出膜后15 dph、30 dph和60 dph)的翘嘴鳜白肌中,在15 dph和30 dph快长组的表达量显著高于慢长组,而到60 dph时快长组的表达量均显著低于慢长组.翘嘴鳜MYH-7a、MYH-7b在快长组与慢长组鱼中的差异表达提示它们在翘嘴鳜胚胎及其早期生长发育过程中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶星	中国水产科学研究院珠江水产研究所	84	1239	20.0	31.0
3	田园园	中国水产科学研究院珠江水产研究所	14	278	7.0	14.0
4	孙成飞	中国水产科学研究院珠江水产研究所	7	34	3.0	5.0
5	董浚键	中国水产科学研究院珠江水产研究所	7	34	3.0	5.0
6	陈之航	中国水产科学研究院珠江水产研究所	1	7	1.0	1.0