乌拉尔图小麦全基因组NBS-SSR位点分析及标记开发

• 作者: 乔麟轶 刘静 张晓军 朱艳 李欣 畅志坚 詹海仙 郭慧娟
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 乌拉尔图小麦 NBS类基因 SSR标记 抗病
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种与栽培
• 页码范围: 153-157
• 页数: 5页
• 分类号: S435.121
• 语种: 中文

摘要

[目的]本研究旨在诊断乌拉尔图小麦NBS家族所在基因组序列的SSR位点,并为抗源的发掘和利用开发分子标记.[方法]利用NBS隐马模型文件检索数据库获得目标序列,通过软件诊断序列SSR位点并开发标记,利用乌拉尔图小麦抗白粉病材料UR207和感病材料UR203进行标记验证.[结果]本研究从乌拉尔图小麦全基因组中分离出463个NBS基因,分为N、CN、NL和CNL共4类.从NBS所在scaffold序列上发现4 292个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占78.1％.随机开发了42个分布于各染色体臂的TuNBS-SSR标记,有12个标记在UR207和UR203间存在多态性.[结论]本研究从乌拉尔图小麦全基因组中诊断出4 292个NBS-SSR位点,开发的12个标记在抗感材料间有多态性,可用于乌拉尔图小麦材料抗病性鉴定和抗病基因筛选.