猫科动物DNA条形码及线粒体假基因对物种鉴定的影响

• 作者: 张亮 李佳凌 蔡延森 赵矫
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: COⅠ 猫科 线粒体假基因
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 基础资料
• 页码范围: 425-430
• 页数: 6页
• 分类号: Q959.8
• 字数: 4116字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20170079

摘要

在多种动物类群中,基于线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ (COⅠ)基因的DNA条形码是一种高效的物种鉴别手段,然而猫科Felidae动物中广泛存在的线粒体假基因可能影响DNA条形码的有效性.本研究共涉及猫科动物12属25种119个样本.采用3对条形码通用引物对6属11种29个猫科动物样本进行了扩增及测序.结果3个样本扩增失败,8个样本得到假基因,18个样本获得了条形码序列.结合另外93条猫科动物条形码序列(源自BOLD Systems),采用Kimura 2-parameter模型计算遗传距离,构建Neighbor-Joining(NJ)树.结果显示,遗传距离种内为0％ ～8.1％,平均0.8％;种间为1.4％ ～13.1％,平均8.7％;属间为8.2％ ～21.8％,平均15.1％.NJ树显示,除3个种外,其余物种均以极高的置信度(99％)形成单系分支.而假基因序列有些可以单独形成分支,有些夹杂在COⅠ序列形成的分支中,对物种鉴定产生干扰.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡延森	西南医科大学医学细胞生物学与遗传学教研室	2	0	0.0	0.0
2	李佳凌	西南医科大学形态学研究室	2	0	0.0	0.0
3	赵矫	西南医科大学医学细胞生物学与遗传学教研室	2	0	0.0	0.0