基于RNA-Seq的辣木叶转录组研究

• 作者: 叶新福 张雅玲 潘少霖 王小安
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣木 转录组 功能注释
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 园艺科学
• 页码范围: 1111-1117
• 页数: 7页
• 分类号: S792.99
• 字数: 4391字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2017.010.013

摘要

为探讨辣木叶营养价值形成的遗传基础,采用RNA-seq对不同发育时期的辣木叶混合样品进行转录组测序,获得44 056 449个reads,共组装得到75 452条unigene,平均长度为795.69 nt,其中有15 824条unigene长度大于1 000 nt.采用公共数据库进行同源比对,共有30 847条unigene得到注释.其中,有18 277条unigenes被注释到GO数据库的52个功能组,9 689条unigene在COG数据库中得到注释.有10 130条unigene被富集到129条KEGG途径,包括碳代谢、氨基酸生物合成和氧化磷酸化途径.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	潘少霖	福建省农业科学院果树研究所	58	248	9.0	13.0
2	叶新福	福建省农业科学院果树研究所	119	505	11.0	17.0
3	王小安	福建省农业科学院果树研究所	35	69	4.0	7.0
4	张雅玲	福建省农业科学院果树研究所	5	2	1.0	1.0