基于线粒体16S rRNA探讨渤海海区矮拟帽贝的种群生态遗传

• 作者: 侯建海 刘传林 刘楚童 史博洋 房辉 曲江勇 李媛媛 王儒晓 郭承华
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 矮拟帽贝 16S rRNA 生态遗传 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 386-391
• 页数: 6页
• 分类号: Q145|Q346
• 字数: 3720字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11984/j.issn.1000-7083.20170013

摘要

采用聚合酶链式反应和直接测序的方法研究了渤海海区15个矮拟帽贝Patelloida pygmaea种群遗传多样性与环境因子的关系.180个个体的16S rRNA部分序列(615 bp)共发现264个多态性位点,153个转换,114个颠换,界定32个单倍型.所有个体碱基含量依次为C(18.12％)、T(27.74％)、A(33.07％)、G(21.07％);单倍型多样性为0.835 1±0.019 l,核苷酸多样性为0.449±0.214.矮拟帽贝大陆沿岸种群核苷酸多样性(0.191 8±0.091 7)高于岛屿种群(0.107 3 ±0.081 6).种群历史动态结果显示,矮拟帽贝经历了种群近期扩张.与环境因子相关性研究发现,遗传距离、序列变异、核苷酸多样性与日照时数、日照百分率分别呈显著正相关(P＜0.05);形态相关分析结果表明,变异主成分(壳长、壳宽)与年均降水量呈显著负相关(P＜0.05);年均降水量、日照时数、日照百分率是影响矮拟帽贝形态变异、遗传多样性的主导因子,环境越稳定地区种群的遗传多样性越高.