伽师瓜和86-1甜瓜几丁质酶基因的克隆与序列分析

• 作者: 冯作山 张培岭 白羽嘉 黄伟
• 来源期刊: 保鲜与加工
• 关键词: 甜瓜 几丁质酶 基因克隆 序列分析 耐藏性
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 检测分析
• 页码范围: 94-100,107
• 页数: 8页
• 分类号: S652
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-6221.2017.04.018

摘要

以新疆主产不同耐藏性的甜瓜品种伽师瓜(耐藏性好)和86-1甜瓜(新密11号,耐藏性差)为试料,利用甜瓜基因组辅助设计引物克隆几丁质酶基因的cDNA序列,分别对其编码序列(CDS)及编码氨基酸进行相关生物信息学的预测分析,以期通过研究二者之间基因的差异揭示伽师瓜和86-1甜瓜采后不同耐藏性的机制.结果表明,获得的伽师瓜几丁质酶基因(JiaShi Melon chitinase,JSMC2),NCBI检索号为KT921406;86-1甜瓜几丁质酶基因(XinMi-11 melon chitinase,XMMC),NCBI检索号为KU236388.JSMC2和XMMC序列长度均为1 011 bp,包含完整的开放阅读框,编码336个氨基酸,与黄瓜几丁质酶基因具有高度的同源性.蛋白结构域预测分析表明,甜瓜几丁质酶蛋白包含GH 18_hevamine_XipⅠ_class_Ⅲ、Chi1、GH 18_chitinase-like super family、Glyco-hydro-18和Glyco_ 18保守结构域,可催化几丁质水解成N-乙酰葡糖胺,分解真菌细胞的细胞壁,抵御病原真菌的侵染.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	冯作山		210	1367	19.0	26.0
2	白羽嘉		68	130	6.0	9.0
3	黄伟		12	188	3.0	12.0
4	张培岭		9	15	3.0	3.0