牛卵泡可卡因-苯丙胺调节转录肽候选受体的筛选

• 作者: 吕丽华 孟金柱 张子宁 景炅婕 李鹏飞 毕锡麟 王锴
• 来源期刊: 山西农业大学学报(自然科学版)
• 关键词: 牛卵泡 CART 候选受体 跨膜螺旋 表达基因 G蛋白偶联受体
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 动物
• 页码范围: 263-267
• 页数: 5页
• 分类号: S823
• 语种: 中文

摘要

[目的]本研究旨在筛选牛卵泡可卡因-苯丙胺调节转录肽(cocnine-and amphetamine-regulate transcript,CART)候选受体.[方法]首先对牛卵泡转录组深度测序所获得的35 325个表达基因进行筛选,选出ODF1/ODF2(发情周期第一卵泡波的最大卵泡/第二大卵泡)趋近于无穷大的部分和比值在1.5～2.0之间的部分基因,找出它们的gene symbol,然后利用NCBI和CELLULAR进行亚细胞定位,最后利用跨膜螺旋软件进行α跨膜螺旋区预测,从中筛选出含有7个α螺旋跨膜区的膜蛋白,进而筛选出CART的候选受体.[结果]通过差异表达基因的筛选、亚细胞定位和跨膜螺旋区预测最终获得了11个高表达基因,并根据筛选出的23个G蛋白偶联受体的结构和功能,结合神经肽受体的特征,找出了4个G蛋白偶联受体作为CART的候选受体.[结论]最终将AGTR2、HTR2B、S1PR1、S1PR2作为CART的候选受体,为以后进一步研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕丽华	山西农业大学动物科技学院	67	172	7.0	8.0
2	李鹏飞	山西农业大学生命科学学院	65	175	7.0	9.0
3	孟金柱	山西农业大学动物科技学院	8	16	3.0	3.0
4	景炅婕	山西农业大学动物科技学院	23	51	5.0	5.0
5	王锴	山西农业大学动物科技学院	11	17	3.0	3.0
6	毕锡麟	山西农业大学动物科技学院	10	17	3.0	3.0
7	张子宁	山西农业大学生命科学学院	2	0	0.0	0.0