山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的miRNA表达谱变化分析

• 作者: 张纹纹 李基棕 李文良 杨蕾蕾 毛立 江杰元 郝飞
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 山羊副流感病毒3型 miRNA MDBK细胞 高通量测序
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 896-906
• 页数: 11页
• 分类号: S852.659.5
• 字数: 5240字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2017.05.014

摘要

本研究旨在分析山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞和正常MDBK细胞差异表达的miRNA,以探索miRNA在CPIV3感染过程中的作用及其调控机制.将CPIV3感染MDBK细胞,利用高通量测序技术检测分析MDBK细胞中miRNA表达谱,并筛选差异表达的miRNA.对靶基因进行GO注释和KEGG富集.结果显示,有37个miRNA显著差异表达(P＜0.001),其中18个miRNA在病毒感染中上调,19个miRNA在病毒感染中下调.经RT-qPCR方法验证5个差异表达的候选miRNA,结果与高通量测序分析有很好的一致性.进一步GO功能注释表明:差异表达的miRNA靶基因生物学功能相对集中在免疫调节、细胞生物调控及细胞新陈代谢等生物过程.这些靶基因参与多种细胞的信号通路,包括细胞黏附分子、B细胞受体信号通路、MAPK信号通路、代谢通路、黏合斑、钙离子信号通路和趋化因子信号通路等.本研究为进一步探讨CPIV3致病机制奠定了基础.