小桐子HXT基因家族的全基因组鉴定及表达分析

• 作者: 王海波 辛胡 高永
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 小桐子 己糖转运蛋白 己糖信号 基因组 表达分析
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 97-105
• 页数: 9页
• 分类号: Q78
• 字数: 5458字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.05.015

摘要

为了进一步理解己糖转运蛋白基因家族的结构特征以及其在植物逆境信号转导过程中的作用,基于小桐子基因组数据,鉴定到15个小桐子己糖转运蛋白基因,并对其基因结构、进化关系、密码子偏性及低温表达特性进行了分析.结果表明,15个小桐子HXT基因聚类为5个亚组,包含2～5个外显子,且在基因上游调控区包含ABA、乙烯、干旱及低温等逆境响应元件.编码蛋白质都富含疏水性氨基酸,具有典型的12个α-螺旋跨膜区.另外,部分小桐子HXT基因存在交叉共线性关系及基因倍增现象,且密码子的第3位碱基偏好使用U或A.荧光定量分析显示,JcHXT_13L与JcHXT_C基因在小桐子的各器官中都有表达,其中,JcHXT_13L在茎中表达量较高,而JcHXT_C在根中表达量较高,JcHXT_13L与JcHXT_C在根与叶片中受低温诱导上调表达明显,与小桐子的抗冷性形成直接相关.为进一步探索小桐子HXT基因的生物学功能及参与小桐子抗冷分子机制奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王海波		21	75	5.0	8.0
5	高永		1	2	1.0	1.0