土壤中立枯丝核菌AG3菌核的荧光定量PCR快速检测

• 作者: 沈瑞清 王喜刚 申永铭 胡小平 郭成瑾 陈爱昌
• 来源期刊: 菌物学报
• 关键词: 实时定量PCR 水筛法 马铃薯黑痣病
• 年，卷（期）: 2017,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1383-1391
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13346/j.mycosystema.170050

摘要

立枯丝核菌Rhizoctonia solani融合群3(anastomosis group 3,AG3)是引发马铃薯黑痣病的主要病原菌,严重威胁着马铃薯产业的发展.菌核是马铃薯黑痣病菌在土壤中的主要存活结构,是马铃薯黑痣病的初侵染源,其密度直接影响马铃薯黑痣病的发病率和严重程度.为快速准确地检测出土壤中菌核的密度,本研究以立枯丝核菌AG3转录间区(ITS)特异性引物RsTqF1/RsTqR1扩增产物的重组质粒为标准品,构建SYBR Green Ⅰ实时定量PCR (qPCR)检测体系,结合水筛法与Fast DNA Spin Kit for Soil土壤DNA提取试剂盒对土壤样品进行DNA提取,建立了循环域值(Ct)与土壤中立枯丝核菌AG3菌核密度的关系,并与传统选择性培养基筛选法进行比较.结果表明,实时定量PCR检测灵敏度比常规PCR高10倍,土壤中菌核密度n(g/g土)和Ct值之间的关系为:n=10(9.6917-Ct)/3.4558.相比较于选择性培养基筛选法,水筛qPCR法能够更加快速准确地检测出土壤中立枯丝核菌的菌核密度.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈瑞清	宁夏农林科学院植物保护研究所	81	553	14.0	18.0
2	胡小平	西北农林科技大学植物保护学院	42	351	11.0	17.0
3	郭成瑾	宁夏农林科学院植物保护研究所	24	117	7.0	9.0
4	王喜刚	宁夏农林科学院植物保护研究所	11	20	3.0	4.0
5	申永铭	西北农林科技大学植物保护学院	2	11	2.0	2.0