弓形虫致密颗粒蛋白GRA12的生物信息学分析

• 作者: 姚新华 宫鹏涛 曹利利 王英贺 苑淑贤 董航 郭衍冰 魏峰
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 弓形虫 GRA12 生物信息学 蛋白质结构 抗原表位
• 年，卷（期）: 2017,（4）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 74-78
• 页数: 5页
• 分类号: Q81|S852.7
• 字数: 2775字
• 语种: 中文

摘要

为分析并预测弓形虫致密颗粒蛋白GRA12基因编码蛋白的结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性,本研究从GenBank数据库获取GRA12基因序列,通过在线蛋白分析专家系统(Expasy)并结合GENERUNR、DNAStar、DNAMAN等生物信息学分析软件对GRA12序列的编码区进行分析、对该基因编码蛋白质的理化性质、信号肽、跨膜结构域、二级结构、亲/疏水性、抗原表位等信息预测.结果表明:该基因全长1 311 bp,编码436个氨基酸,蛋白性质稳定,理论分子质量约为47.8 ku,无信号肽,有6个跨膜区,14个丝氨酸磷酸化位点、7个苏氨酸磷酸化位点、3个酪氨酸磷酸化位点、18个O-糖基化位点、3个乙酰化蛋白附着位点、1个酪氨酸硫酸化位点、1个潜在的N-糖基化位点、1个棕榈酰化位点,15个潜在的抗原表位.研究结果分析说明GRA12有潜力成为弓形虫疫苗候选抗原.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	姚新华		47	121	6.0	8.0
2	苑淑贤		34	92	6.0	7.0
3	宫鹏涛	吉林大学畜牧兽医学院	134	291	8.0	14.0
4	郭衍冰		27	54	4.0	6.0
5	曹利利		25	62	4.0	6.0
6	王英贺	吉林农业大学生命科学学院	7	17	2.0	3.0
8	董航		39	31	2.0	4.0