陕西省部分地区猪圆环病毒2型全基因组的遗传变异分析

• 作者: 于三科 付明哲 何亚鹏 张琪 徐丽美 许信刚
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒2型 全基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2017,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 22-26
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 3732字
• 语种: 中文

摘要

为了解陕西省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,根据GenBank登录的PCV2全基因组序列,设计1对引物,从陕西省部分地区规模化猪场疑似PCV2感染的病猪采集病料9份,应用PCR扩增PCV2的全基因,其中6份为阳性,并对扩增的6个PCV2全基因组序列进行测序和序列分析.基因测序表明,PCV2基因组全长为1 767 bp;对6株病毒序列进行同源性比较,6个毒株全基因之间核苷酸同源性为98.3%~100%,与GenBank上已发表的国内外毒株全基因组比较,同源性为96.3%~97.8%;与近几年陕西株比较发现基因变异程度不稳定,与2013年分离株(KX352154.1)同源性最高,2015年分离株(KX352159.1)次之,反而与2014年分离株(KX068219.1)最低;对6个毒株的ORF1和ORF2基因进行同源性比较,6个毒株的ORF1和ORF2基因的核苷酸同源性分别为98.1%~100%和98.2%~100%,与GenBank上已发表的国内外参考株ORF1和ORF2基因进行同源性比较,同源性分别为97.6%~99.8%和91.5~96.0%.陕西省流行的PCV2基因组较为保守,变异不大,同源性很高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许信刚	西北农林科技大学动物医学院	116	501	10.0	14.0
2	张琪	西北农林科技大学动物医学院	75	218	9.0	11.0
3	付明哲	西北农林科技大学动物医学院	94	346	10.0	14.0
4	于三科	西北农林科技大学动物医学院	78	474	10.0	18.0
5	徐丽美	西北农林科技大学动物医学院	5	4	1.0	2.0
6	何亚鹏	西北农林科技大学动物医学院	20	41	4.0	5.0