马铃薯扩展蛋白基因家族的鉴定与表达分析

• 作者: 代丹丹 杨铁钢 理向阳 郝西
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 马铃薯 扩展蛋白 生物信息学 基因家族
• 年，卷（期）: 2017,（5）
• 页码范围: 37-44
• 页数: 8页
• 分类号: Q78
• 字数: 4468字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2017.05.007

摘要

为了分析马铃薯扩展蛋白基因家族的进化与功能,鉴定了马铃薯的扩展蛋白基因家族,分析了其基因结构特征、系统发育及表达模式等.结果表明,马铃薯基因组包含33个扩展蛋白基因,包括A(21)、B(5)、LA(1)和LB(6)4个亚家族,分布在马铃薯11条染色体上.扩展蛋白氨基酸长度为194～488 aa,编码蛋白质具有保守的结构域,蛋白质亚细胞定位预测结果表明所有蛋白均定位于细胞外.基因结构分析表明,马铃薯扩展蛋白家族有23个基因(69.7％)含有2～3个内含子.基因表达分析发现,该家族基因在马铃薯根、茎、匍匐茎、果实及块茎发育过程中表达丰度较高,并且其表达受到高温、盐、激素及病害等逆境的调控.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	理向阳	河南省农业科学院经济作物研究所	20	128	4.0	11.0
2	代丹丹	河南省农业科学院经济作物研究所	12	34	4.0	5.0
3	郝西	河南省农业科学院经济作物研究所	15	36	4.0	5.0
4	杨铁钢	河南省农业科学院经济作物研究所	42	377	10.0	18.0